Основным наполнением «Музея науки» организаторы называют не экспонаты, а множество образовательных программ для посетителей разного возраста: от туров для учителей и захватывающих научных шоу до открытых лекций и обучающих программ для семей. Образовательная программа музея будет обновляться каждые два месяца. Также после посещения пространства можно будет записаться в научные кружки, секции и студии, а позже и в лаборатории, исследовательские экспедиции и даже проекты CERN, ANL, NASA, с которыми сотрудничает МАНУ. Только за лето 2020 года ученики МАНУ завоевали 65 международных наград на конкурсах изобретателей. Открывая «Музей науки», организаторы хотят выстроить непрерывную вертикаль от первого удивления и интереса до самореализации в научной сфере и собственных открытий.
На период карантина в пространстве предусмотрены усиленные меры безопасности, рекомендованные Минздравом, а именно: вход в масках, ограничение количества посетителей благодаря предварительной покупке билетов онлайн с фиксированным временем, дезинфекция интерактивных элементов экспонатов и других поверхностей.